Z różnego typu ograniczeń badawczych może okazać się, że podstawowa opinia grafologiczna nie odpowie jednoznacznie na pytania opinii. Może na to wpłynąć niedostatek materiału porównawczego, ograniczona forma materiału porównawczego, itp. W takim przypadku wymaganym będzie sporządzenie opinii uzupełniającej. Jest ona wykonywana po usunięciu całości lub części ograniczeń badawczych. Jej celem jest wykonanie zakresu badań, który w opinii podstawowej nie był możliwy do wykonania oraz uzyskanie jednoznacznych wniosków końcowych.

W prostym podziale ekspertyza grafologiczna rozpoczynana jest od zapoznania się z zadaniami eksperta i określenia materiałów badawczych. Kolejno przeprowadza się ocenę materiału kwestionowanego i porównawczego. Następnie rozpoczynany jest etap badań konfrontacyjnych. Na podstawie badań szczegółowych formułowane są wnioski końcowe oraz wykonywane są tablice poglądowe prezentujące cechy na których oparto wniosek końcowy.

Czasami urzędnicy państwowi nie zauważają że podpis jest sfałszowany. Przyjmują oni ogólne podobieństwo podpisu jako wystarczające do przyjęcia autentyczności podpisu. Jednak przy bliższym przejrzeniu widać nienaturalne cechy pisma np. W postaci retuszy, zatrzymań długopisy i złamań linii pisma. Tego typu cechy są charakterystyczne przy podrobieniu podpisu.